Foi o primeiro museu a ser criado em Portugal dedicado, apenas, à Geologia e à Arqueologia e, desde então, integrado nos organismos que a nível nacional têm vindo a cartografar e investigar a infraestrutura geológica portuguesa (Comissões Geológicas, Serviços Geológicos de Portugal, Instituto Geológico e Mineiro). É detentor de um longo historial marcado pela passagem de grandes investigadores, designadamente dos pioneiros da Geologia e da Arqueologia portuguesas.
O facto da sua conceptualização, arquitectura interior e principal mobiliário expositivo pouco ter variado ao longo dos anos, confere-lhe valor histórico e estético e converte-o naquilo que alguns especialistas consideram um “museu dos museus”, podendo considerar-se um dos poucos testemunhos da museologia cientifica novecentista, não apenas portuguesa, mas europeia.
Assim, além do seu valioso acervo científico e do valor histórico museológico, pode dizer-se que foi nestas Instalações que nasceram e se afirmaram a Geologia e a Arqueologia portuguesas.
O Museu Geológico é, assim, um valor excepcional no âmbito do nosso património cultural.
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